Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn3Q60764 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms