Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha1Q60750 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms