Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxd4Q60688 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms