Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms