Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp20Q5XG71 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms