Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnajc11Q5U458 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms