Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rabl6Q5U3K5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms