Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms