Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myh1Q5SX40 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms