Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsr1Q5SWD9 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms