Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb5d2Q5SSH8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms