Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sun3Q5SS91 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms