Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms