Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc85aQ5SP85 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms