Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlha9Q5RJB0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms