Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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