Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttf2Q5NC05 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttf2Q5NC05 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms