Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps41Q5KU39 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps41Q5KU39 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms