Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp22Q5DU02 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms