Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Urb1Q571H0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Urb1Q571H0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Urb1Q571H0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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