Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms