Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc84Q4VA36 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms