Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xirp2Q4U4S6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms