Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms