Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms