Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rimbp3Q3V0F0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rimbp3Q3V0F0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms