Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3V0E1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms