Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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