Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prdm6Q3UZD5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prdm6Q3UZD5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Prdm6Q3UZD5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm6Q3UZD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Prdm6Q3UZD5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Prdm6Q3UZD5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Prdm6Q3UZD5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Prdm6Q3UZD5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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