Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn4Q3UWL8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms