Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms