Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms