Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Chpf2Q3UU43 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chpf2Q3UU43 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms