Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms