Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skap2Q3UND0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms