Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms