Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms