Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms