Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms