Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtpbp2Q3UJK4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms