Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms