Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Greb1Q3UHK3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms