Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms