Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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