Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms