Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsrp1Q3UC65 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms