Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U595 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U595 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U595 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U595 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U595 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U595 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U595 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U595 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U595 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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