Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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