Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec24aQ3U2P1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms