Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C4

Secisbp2, MCG1271, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2Q3U1C4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Secisbp2Q3U1C4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms